Pada awalnya STAI Kuala Kapuas adalah Fakultas Tarbiyah dengan program Sarjana Muda yang didirikan pada tahun 1985 di bawah naungan Yayasan Pondok Pesantren Karya Pembangunan.
Pesantren Entrepreneur Dar Al-Raudhah Pangkalan Bun Kalimantan Tengah
Pesantren Al Fajar Parenggean Kotawaringin Timur Kalimantan Tengah
Pesantren Darul Amin Sampit Kabupaten Kotawaringin Timur Kalimantan Tengah